MemoryError: Unable to allocate 159. GiB for an array with shape (285196, 598335) and data type uint8

メモリエラーが発生したようです。このエラーは、データセットが非常に大きいため、コンピュータのメモリに収まらないことが原因です。

このような場合、次のいくつかの方法で問題を解決できます:

  1. サンプリング: データセットからランダムにサンプリングして、サイズを削減することができます。ただし、サンプリングによってデータの偏りが生じる可能性があるため、注意が必要です。

  2. 特徴量の選択または次元削減: 特徴量の数を減らすことで、データセットのサイズを削減できます。主成分分析(PCA)や特徴量の重要度に基づく選択などの次元削減手法を使用することができます。

  3. モデルの選択: メモリの使用量が少ないモデルを選択することも有効です。例えば、LightGBMやCatBoostなどの勾配ブースティングモデルは、メモリ使用量が比較的少ない傾向があります。

  4. ハードウェアのアップグレード: メモリが不足している場合、より多くのメモリを搭載したマシンに移行することで問題を解決できる場合があります。

  5. データの分割: データを複数の部分に分割して処理することも検討できます。これにより、一度に処理するデータの量を減らすことができます。

これらの手法のいずれかを使用して、メモリエラーを解決できることを願っています。

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Posted by ぼっち